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가시나무류의 RAPD 유전분석을 위한 Genomic DNA 최적 추출조건 및 RAPD Primer 선별Optimal Genomic DNA Extraction Conditions and Primer Selection for RAPD Analysis of Evergreen Quercus spp.

Other Titles
Optimal Genomic DNA Extraction Conditions and Primer Selection for RAPD Analysis of Evergreen Quercus spp.
Authors
박동진최명석
Issue Date
2018
Publisher
경상국립대학교 농업생명과학연구원
Keywords
가시나무류; CTAB buffer; Genomic DNA 추출; RAPD 분석; CTAB buffer; Evergreen quercus; Genomic DNA extraction; RAPD analysis
Citation
농업생명과학연구, v.52, no.2, pp 45 - 54
Pages
10
Indexed
KCI
Journal Title
농업생명과학연구
Volume
52
Number
2
Start Page
45
End Page
54
URI
https://scholarworks.gnu.ac.kr/handle/sw.gnu/12800
DOI
10.14397/jals.2018.52.2.45
ISSN
1598-5504
2383-8272
Abstract
유전분석을 위해서, CTAB buffer를 이용하여 가시나무류 4종의 genomic DNA를 분리하였다. CTABbuffer를 이용하여 분리한 genomic DNA의 순도는 Edward buffer를 이용했을 때보다 더 높게 나타났다. 가시나무(Q. myrsinaefolia)로부터적정 순도 gDNA는 2% CTAB에 0, 1 또는 2% PVP가 첨가된 buffer를이용했을 때 얻어졌다. 종가시나무(Q. glauca)로부터 1% CTAB buffer와 1% PVP를 첨가한 buffer를 이용하여 얻은 gDNA 순도는 1.84±0.02(A260/280)였다. 참가시나무(Q. salicina)의 적정순도 gDNA는 2%CTAB와 1 또는 5% PVP가 첨가된 buffer를 이용하여 분리할 수 있었다. 2% CTAB와 2% PVP가 첨가된buffer를 이용했을 때, 졸가시나무(Q. phillyraeoides)의 gDNA의 순도는 1.85±0.01(A260/280)였다. 18개의 RAPD primer를 사용하여 PCR을 수행하였을 때, 가시나무에서는 15개 primer에 의해 53개의 다형질DNA가 발견되었다. 종가시나무에서는 11개의 primer에 의해 40개의 다형질 DNA가 나타났다. 참가시나무의 경우 16개의 primer에 의해 50개의 증폭된 DNA밴드를 확인 할 수 있었다. 졸가시나무에서 14의primer가 증폭반응을 일으켰고, 53개의 다형질 DNA가 나타났다. 이 결과들은 가시나무류의 유전분석에이용할 수 있다.
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Choi, Myung Suk
농업생명과학대학 (환경산림과학부)
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