느티만가닥버섯의 분자유전학적 분류 및 품종특이적 DNA 마커 탐색

Molecular Genetic Classification of Hypsizigus marmoreus and Development of Strain-specific DNA Markers
  • 임윤정; 
  • 박정은; 
  • 김상우; 
  • 이현숙; 
  • 노현수; 
  • 외 1명

초록

느티만가닥버섯의 품종구분을 위하여 국내 버섯보존기관으로부터 수집한 30종의 품종에 대한 RAPD 분석을 실시하였다. 이를 위하여 고체배지상의 균사로부터 염색체 DNA를분리하였고 이를 주형으로 하여 3개의 random primer로PCR 반응을 수행하였다. 그 결과 각 PCR 반응에서 200 bp 에서 3000 bp 범위의 크기를 가진 DNA 밴드 약 30종이 관찰되었다. DNA 밴드 패턴은 UPGMA 방법으로 분석하여 그결과를 dentrogram으로 나타내었다. 느티만가닥버섯은 2개의클러스터로 분석되었으며, 클러스터 1은 다시 3개의 작은 그룹으로 나눌 수 있었다. 반면, 클러스터 2의 경우에는 유전적으로 클러스터 1보다 다양한 품종으로 구성되어 있었다. 흥미롭게도 덕유산에서 채집된 야생종 Hm3-10의 경우 어느 클러스터에도 속하지 않는 고유의 품종임을 확인하였다. RAPD 결과 나타나는 품종별 고유의 DNA 밴드를 품종특이적 마커로 개발하기 위하여, Hm0-4 품종의 250 bp 특이밴드를 TA-클로닝하고 염기서열을 결정하였다. 결정된 염기서열을 바탕으로 PCR primer를 디자인하였고 이를 이용하여 PCR 반응을수행하였다. 그 결과 250 bp DNA 밴드는 Hm0-4 품종에서만관찰되었으며 이는 이러한 접근법이 품종특이적 마커개발에잘 적용됨을 보여주는 것이다.

키워드

Classification; DNA marker; Hypsizigus marmoreus; RAPD
제목
느티만가닥버섯의 분자유전학적 분류 및 품종특이적 DNA 마커 탐색
제목 (타언어)
Molecular Genetic Classification of Hypsizigus marmoreus and Development of Strain-specific DNA Markers
저자
임윤정; 박정은; 김상우; 이현숙; 노현수; 이창윤
발행일
2010
저널명
한국균학회지
권
38
호
1
페이지
34 ~ 39