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전장유전체 관련성 분석을 통한 순종 랜드레이스 생시체중 형질의 위치상 후보유전자 탐색
Genome-wide Association Study Identifies Positional Candidate Genes Affecting Birth Weight Trait in Purebred Landrace
- 강호찬;
- 이재봉;
- 유채경;
- 최태정;
- 임현태
초록
돼지의 생시체중은 생존율과 폐사율에 밀접한 관련이 있어 양돈산업에서 자돈 관리와 직결된 중요한경제형질이다. 본 연구는 Genome-Wide Association Study(GWAS) 분석을 통해 순종 랜드레이스의 생시체중과 관련된 위치상 후보유전자 탐색을 실시하였다. 생시체중의 유의적 관련 분석 결과, genomewidesuggestive level에서 유의성 있는 single nucleotide polymorphism(SNP) marker는 3번 염색체(ASGA0098921, P=2.41×10-5)와 4번 염색체(H3GA0013451, P=2.47×10-5)에서 각각 1개씩 동정되었다. 이들 SNP marker가 위치한 3개의 유전자(LOC110260055, LOC100156472, LOC100157689)들은 순종 랜드레이스 생시체중의 위치상 후보 유전자이며, 이들 유전자 정보를 이용해서 순종 랜드레이스 생시체중을 선발할 수 있는 기초 연구 자료가 될 것으로 사료된다.
키워드
생시체중; 순종 랜드레이스; GWAS; Single nucleotide polymorphism(SNP); Birth weight; GWAS; Purebred Landrace; Single nucleotide polymorphism(SNP)
- 제목
- 전장유전체 관련성 분석을 통한 순종 랜드레이스 생시체중 형질의 위치상 후보유전자 탐색
- 제목 (타언어)
- Genome-wide Association Study Identifies Positional Candidate Genes Affecting Birth Weight Trait in Purebred Landrace
- 저자
- 강호찬; 이재봉; 유채경; 최태정; 임현태
- 발행일
- 2018
- 저널명
- 농업생명과학연구
- 권
- 52
- 호
- 3
- 페이지
- 55 ~ 62