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큰느타리버섯 유전체내 LTR Retrotransposon 유전자 탐색 및 특성연구
Screening and Characterization of LTR Retrotransposons in the genomic DNA of Pleurotus eryngii
- 김신일;
- 레귀방;
- 김선미;
- 노현수
초록
본 연구에서는 큰느타리버섯 유전체내에 있는 retrotransposon의탐색을 위하여 degenerated primer를 이용하여, retrotransposon library를 대장균에 제작하였다. 제작된 library에서총 256개의 콜로니를 선택하여 염기서열을 결정한 결과, 71개가 LTR retrotransposon이며, 이들 중 70개가Gypsy-type LTR retrotransposon임을 염기서열분석을 통하여 확인하였다. 특히 송이에서 발견된 MarY1_TM과 진황녹슨버짐버섯의 Gypsy-8_SLL이 각각 14, 18 copy 이상큰느타리버섯 유전체에 삽입되어 있음을 Southern blot 분석을 통하여 밝혔다. 이와 더불어, 이들이 full length retrotransposon mRNA을 생산하고 있음을 RT-PCR과 northern blot을 통하여 밝힘으로서 활성이 있는 LTR retrotransposon임을증명하였다.
키워드
Degeneration; Pleurotus; Retrotransposon; Transposable element
- 제목
- 큰느타리버섯 유전체내 LTR Retrotransposon 유전자 탐색 및 특성연구
- 제목 (타언어)
- Screening and Characterization of LTR Retrotransposons in the genomic DNA of Pleurotus eryngii
- 저자
- 김신일; 레귀방; 김선미; 노현수
- 발행일
- 2014
- 저널명
- 한국균학회지
- 권
- 42
- 호
- 1
- 페이지
- 50 ~ 56
- 언어
- KOR
- 출판사
- 한국균학회
- 발행국가
- 대한민국
- 분량
- 7 페이지
- ISSN
- E 2383-5249
P 0253-651X