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큰느타리버섯 유전체내 LTR Retrotransposon 유전자 탐색 및 특성연구Screening and Characterization of LTR Retrotransposons in the genomic DNA of Pleurotus eryngii

Other Titles
Screening and Characterization of LTR Retrotransposons in the genomic DNA of Pleurotus eryngii
Authors
김신일레귀방김선미노현수
Issue Date
2014
Publisher
한국균학회
Keywords
Degeneration; Pleurotus; Retrotransposon; Transposable element
Citation
한국균학회지, v.42, no.1, pp 50 - 56
Pages
7
Indexed
KCICANDI
Journal Title
한국균학회지
Volume
42
Number
1
Start Page
50
End Page
56
URI
https://scholarworks.gnu.ac.kr/handle/sw.gnu/19957
ISSN
0253-651X
2383-5249
Abstract
본 연구에서는 큰느타리버섯 유전체내에 있는 retrotransposon의탐색을 위하여 degenerated primer를 이용하여, retrotransposon library를 대장균에 제작하였다. 제작된 library에서총 256개의 콜로니를 선택하여 염기서열을 결정한 결과, 71개가 LTR retrotransposon이며, 이들 중 70개가Gypsy-type LTR retrotransposon임을 염기서열분석을 통하여 확인하였다. 특히 송이에서 발견된 MarY1_TM과 진황녹슨버짐버섯의 Gypsy-8_SLL이 각각 14, 18 copy 이상큰느타리버섯 유전체에 삽입되어 있음을 Southern blot 분석을 통하여 밝혔다. 이와 더불어, 이들이 full length retrotransposon mRNA을 생산하고 있음을 RT-PCR과 northern blot을 통하여 밝힘으로서 활성이 있는 LTR retrotransposon임을증명하였다.
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Ro, Hyeon Su
자연과학대학 (생명과학부)
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